Bij de aanvang van elk zittingsjaar kiest de Raad een voorzitter, die optreedt als zijn vertegenwoordiger. Hij of zij leidt de plenaire vergaderingen en zit de vergaderingen van het Bureau en het Uitgebreid Bureau voor. Het Bureau neemt het dagelijks bestuur voor zijn rekening en het Uitgebreid Bureau regelt de politieke agenda. De voorzitter zorgt voor de uitvoering van de beslissingen, bijgestaan door de griffier.

De voorzitter mengt zich niet in de plenaire besprekingen, zorgt voor het ordelijk verloop van de vergaderingen en de correcte toepassing van het Reglement van Orde, dat de werking van de Raad vastlegt.
De Heer Jean-Luc Vanraes is voorzitter van de VGC-Raad sinds 23 december 2011.

De ondervoorzitter neemt de taken van de voorzitter over wanneer zij verhinderd is of wanneer zij zelf het woord wil voeren in de vergaderingen.
Mevrouw Annemie Maes werd verkozen tot ondervoorzitter van de Raad op 16 juli 2009.